没有两个自闭症儿童的行为是一样的，因此，要处理儿童的行为问题，一定要从最基本的「评估行为」着手。自闭症儿童的行为中，有些是自闭症所特有的自闭性行为，包括人际互动，沟通偏差和同一性行为，譬如：不理人、不看人、听而不闻、视而不见、不会表达情绪，不了解别人的感受等，这些大家都已熟悉，不必在此赘述。自闭症儿童的行为中，也有不少并非自闭症儿童所特有，但会干扰他的学习过程，而且常常使别人觉得他怪，甚至害怕而不知如何处理的行为，这些行为问题可称为适应不良行为问题。自闭症儿童的适应不良行为，有一部份是他本身特殊障碍所致，如：因对外界情境不了解而不会对外界刺激做出适当反应；对外界的事物不感兴趣，因此在别人的感觉里就好像他活在自己的世界里。一部份适应不良行为，在智障儿童也常可看到，如：喜欢坐着摇晃，当无法表达而达不到目的时出现敲头、撞头、在地上打滚或打自己、伤害自己、抓人等行为。这些行为、常是本身学习的困难，

加上照顾者的处置不当以及其他环境因素所造成的。要了解这样复杂的行为问题，一定要对行为进行功能分析。譬如「喜欢撕纸」这个行为，可能三个撕纸的孩子成因不同。第一个可能喜欢听撕纸的声音，第二个喜欢撕的动作，第三个却喜欢撕了以后将它排起来。这三个孩子的行为虽有不同功能，但都表现了相同的撕纸行为。这个例子显示自闭症儿童呈现这些行为，有一部份是因知觉传递和认知缺陷，使他们对某些声音、触觉动作特别感兴趣，而喜欢如此做。另外的儿童却是由于已经习惯这样做，而在他无聊时，以这些行为满足他的感官打发时间。因此，行为问题有一部份是生理的缺陷所导致，有些和养育的习惯有关，有些则有其功能。自闭症儿童的许多问题行为常常是基本缺陷和后天不当养育的结果。大部分自闭症患者在婴儿时期已有学习的缺陷，可是负责养育的人不一定能体会它的存在，觉得只是慢一点或是有一点怪，大一点就会好，而不知道这是自闭症的早期表现，对他的缺陷行为没有矫治它反而放纵继续让它存在。如：他在小时候一听到某一首歌便静下来，很自然地，下一次他吵时或你忙时便放这首歌给他听，这不只是没有适当地教他沟通，反而放纵他用他本来的方法（听某一首歌），解决他的问题。撞头、打滚等行为也常常是基本缺陷和不当养育所造成的。